Schon nach wenigen Jahren hatte er es zum Offizier gebracht und machte Dienst in der Lagerfestung Lorch (Lauriacum) an der Donau. Römische Legionäre brachten dann ei­nes Tages die erste Kunde von Jesus Christus mit ins Lager. Florianus war vom Leben Jesu und dessen Wirken so sehr angetan, dass er diesen Glauben annahm und ein eifri­ger Christ wurde. Er bekannte sich Kraft seines Amtes und hohen gesellschaftlichen Ansehens öffentlich dazu. Eine Herausforderung, die nicht geduldet werden konnte, zumal er mit dieser Haltung für viele Mitchristen Vorbild war, sie in ihrem Religionsbekenntnis bestärkte und neue Glaubensgefährten warb. Da Kaiser Diocletian ein fanatischer Christenverfolger war, duldete er keine Abtrünnigen in seinen Legionen. Unter Kaiser Diocletian kam Statthalter Aquilinus nach Lauriacum um die dortigen Christen auszuforschen. Den Christen wurde Wehrtüchtigkeit und Wehrfähigkeit aberkannt.

Als einer von Ihnen wurde Florianus vor Gericht gestellt und sollte in einer öffentlichen Zeremonie am Altar des Tempels von Lauriacum den heidnischen Göttern dass Opferritual erweisen und damit seinem neuen Glauben abschwören. Florianus wusste, welch große Hoffnung die Christen seiner Truppe in seine Standhaftigkeit legten und weigerte sich, seine Überzeugung zu verraten. Schon diese Haltung hätte sein Todesurteil besiegeln können. Doch fürchteten die Richter den Protest des Volkes und der Legionäre. Sie schickten Florianus in die Verbannung. 40 seiner Kameraden aber wurden verhaftet und in einem langwierigen Prozess zum Tode verurteilt.

Als Florianus von den Verhaftungen erfuhr fühlte er sich seinen Waffengefährten zur Hilfe verpflichtet und kehrte nach Lauriacum zurück. Er versuchte mit seinem Einfluss den Glaubensgefährten zur Hilfe zu kommen. In Lauriacumn aber wurde er von seinen ehemaligen  nichtchristlichen Militärkameraden aufgegriffen, verhaftet und erneut vor den Statthalter Aquilinus geführt. Da er sich standhaft weigerte, dem christlichen Glauben abzuschwören, wurde Florian einer Folterprozedur unterzogen: Geißel und Stockhiebe, Treten und Quetschen, Sen­gen mit glühender Zange und brennender Fackel bis zur Bewusstlosigkeit. Als Aquilinus merkte, dass der Gequälte in seiner Treue zu Christus nicht wankte, gab er am 4. Mai des Jahres 304 den Befehl, Florian mit einem Mühlstein um den Hals von einer Brücke des Emsflusses zu stürzen. Florianus ertrank und auch die 40 gefangenen Christen wurden hingerichtet. 
Nur acht Jahre nach der Hinrichtung wurde unter Kaiser Konstantin den römischen Christen die volle Glaubensfreiheit zugesichert. So endet die authentische Leidensgeschichte des Römers Florianus. Im frühen Mittelalter wurde Florian Heilig gesprochen und ist seitdem einer der wichtigsten Schutzpatrone der katholischen Kirche.

Eine weitere Legende berichtet das vor seiner Hinrichtung Florianus eine Stunde lang betete. Keiner der dort anwesenden Legionssoldaten brachte den Mut auf den ehemaligen Waffengefährten zu unterbrechen. Ehrfurchtsvoll verharrten sie vor ihm und seinem starken Glauben an diese neue Gottheit und sie scheuten sich das Todesurteil zu vollstrecken. Ein ungeduldiger junger Mann aus der Menge welchem die Warterei zulange dauerte stieß ihn schließlich von der Brücke hinab in den Fluss. Jenem Mann brachen einige Tage später seine Augen aus dem Schädel und er blieb sein restliches Leben blind.